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研究为抗生素耐药性和顺应性景观理论提供了新的看法
宣布时间:2023-11-24
作者:sunbet医学

揭晓在《科学》杂志上的一项新研究批注 ,大肠杆菌可能比科学家之前以为的更有能力进化出抗生素耐药性。

SFI外部教授Andreas Wagner的向导下 ,研究职员通过实验绘制了一种大肠杆菌卵白的26万多种可能突变 ,这种卵白质在袒露于抗生素甲氧苄啶时对细菌的生涯至关主要。

在数千个高度逼真的数字模拟历程中 ,研究职员发明 ,大肠杆菌卵白所有可能的进化路径中 ,有75%最终付与了细菌云云高的抗生素耐药性 ,以至于临床医生不再给病人使用抗生素甲氧苄啶。

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Wagner是瑞士苏黎世大学的进化生物学家 ,他说:“从实质上讲 ,这项研究批注 ,像大肠杆菌这样的细菌可能比我们最初想象的更善于进化出对抗生素的耐药性 ,这对明确进化生物学、化学和其他领域的种种系统怎样顺应和进化具有更普遍的意义。”

除了发明关于抗生素耐药性的令人担心的新发明外 ,研究职员的事情还对一个恒久保存的关于康健景观的理论提出了质疑。这些基因图谱代表了一个有机体——或者它的一部分 ,好比卵白质——顺应情形的能力。

在适合度景观中 ,景观上的差别点代表生物体的差别基因型 ,这些点的高度代表每种基因型对其情形的顺应水平。用进化生物学的术语来说 ,目的是找到最岑岭 ,即最适合的基因型。

关于顺应性景观的主流理论展望 ,在高度崎岖的景观中 ,或者有多个顺应性岑岭的景观中 ,大大都进化种群将被困在较低的岑岭上 ,永远不会抵达进化顺应的巅峰。

然而 ,到现在为止 ,由于缺乏足够大的健身景观的实验数据 ,测试这一理论一直很是难题。

为了应对这一挑战 ,Wagner及其同事使用CRISPR基因编辑手艺为大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)卵白建设了迄今为止最完整的组合顺应度景观之一。

他们的发明令人惊讶。地形上有许多山峰 ,但大大都都是低顺应性的 ,使它们对顺应不那么感兴趣。然而 ,纵然在这种崎岖不平的情形中 ,他们模拟的约莫75%的种群抵达了高顺应性峰值 ,这将使大肠杆菌具有高度的抗生素耐药性。

现实天下的影响是重大的。若是像这样崎岖不平的景观在生物系统中很常见 ,这可能意味着许多顺应性历程 ,如抗生素耐药性 ,可能比以前想象的更容易实现。

这一效果可能最终导致对各个领域理论模子的重新评估 ,并推动对现实天下景观怎样影响进化历程的进一步研究。

Wagner说:“这不但对生物学有深远的影响 ,并且对其他领域也有深远的影响 ,促使我们重新评估我们对各个领域景观进化的明确。”“我们需要从笼统的理论模子转向基于数据的、现实的景观模子。”

期刊:Science

DOI:10.1126/science.adh3860 

文章问题:A rugged yet easily navigable fitness landscape

研究为抗生素耐药性和顺应性景观理论提供了新的看法
宣布时间:2023-11-24
作者:sunbet医学

揭晓在《科学》杂志上的一项新研究批注 ,大肠杆菌可能比科学家之前以为的更有能力进化出抗生素耐药性。

SFI外部教授Andreas Wagner的向导下 ,研究职员通过实验绘制了一种大肠杆菌卵白的26万多种可能突变 ,这种卵白质在袒露于抗生素甲氧苄啶时对细菌的生涯至关主要。

在数千个高度逼真的数字模拟历程中 ,研究职员发明 ,大肠杆菌卵白所有可能的进化路径中 ,有75%最终付与了细菌云云高的抗生素耐药性 ,以至于临床医生不再给病人使用抗生素甲氧苄啶。

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除了发明关于抗生素耐药性的令人担心的新发明外 ,研究职员的事情还对一个恒久保存的关于康健景观的理论提出了质疑。这些基因图谱代表了一个有机体——或者它的一部分 ,好比卵白质——顺应情形的能力。

在适合度景观中 ,景观上的差别点代表生物体的差别基因型 ,这些点的高度代表每种基因型对其情形的顺应水平。用进化生物学的术语来说 ,目的是找到最岑岭 ,即最适合的基因型。

关于顺应性景观的主流理论展望 ,在高度崎岖的景观中 ,或者有多个顺应性岑岭的景观中 ,大大都进化种群将被困在较低的岑岭上 ,永远不会抵达进化顺应的巅峰。

然而 ,到现在为止 ,由于缺乏足够大的健身景观的实验数据 ,测试这一理论一直很是难题。

为了应对这一挑战 ,Wagner及其同事使用CRISPR基因编辑手艺为大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)卵白建设了迄今为止最完整的组合顺应度景观之一。

他们的发明令人惊讶。地形上有许多山峰 ,但大大都都是低顺应性的 ,使它们对顺应不那么感兴趣。然而 ,纵然在这种崎岖不平的情形中 ,他们模拟的约莫75%的种群抵达了高顺应性峰值 ,这将使大肠杆菌具有高度的抗生素耐药性。

现实天下的影响是重大的。若是像这样崎岖不平的景观在生物系统中很常见 ,这可能意味着许多顺应性历程 ,如抗生素耐药性 ,可能比以前想象的更容易实现。

这一效果可能最终导致对各个领域理论模子的重新评估 ,并推动对现实天下景观怎样影响进化历程的进一步研究。

Wagner说:“这不但对生物学有深远的影响 ,并且对其他领域也有深远的影响 ,促使我们重新评估我们对各个领域景观进化的明确。”“我们需要从笼统的理论模子转向基于数据的、现实的景观模子。”

期刊:Science

DOI:10.1126/science.adh3860 

文章问题:A rugged yet easily navigable fitness landscape

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