范安德尔研究所的科学家们在常见的代谢物样本中识别出了凌驾1000种以前未被检测到的卵白质。只管已接纳了专门设计的提取要领试图扫除这些卵白质,但它们仍然保存。
这项效果已揭晓在《自然通讯》期刊上,它为科学家们在未来的代谢组学实验中提供了新的看法和工具,包括一种在提取历程中移除这些卵白质的新协议。该研究并未使之前的研究效果失效,而是强调了在实验设计和剖析中接纳适当的比照和验证的主要性。
“科学的前进往往源于无意和敏锐的视察。在这种情形下,我们在一项实验中视察到了一个奇异的效果,进一步研究后,我们发明了大宗在标准代谢物提取历程中被忽视的卵白质,”范安德尔研究所质谱焦点主任、研究通讯作者瑞安·谢尔顿博士体现。“这些卵白质可能掩饰现实效果,有可能导致假阳性或假阴性效果。我们希望sunbet发明能提高人们对这些隐匿卵白的熟悉,并进一步强化代谢组学领域。”
恒久以来,人们普遍以为用于提取代谢物的化学试剂会破损样本中的卵白质,从而阻止它们滋扰最终剖析。然而,研究显示,有些卵白质能够存活下来,这可能改变提取样本所需的表型,进而影响实验效果。
为了筛除这些可能带来问题的卵白质,谢尔顿及其团队在标准提取流程中加入了一个过滤办法,以去除大于3千道尔顿的卵白质——这一标准涵盖了大部分卵白质。
“归根结底,我们可以拥有天下上最先进的仪器,但若是样本准备保存问题,那么手艺的助力也只能到此为止,”谢尔顿体现。“确保sunbet实验表型不受任何滋扰卵白的影响关于获得准确的实验效果至关主要。sunbet发明将有助于实现这一点。”
杂志:Nature Communications
DOI:10.1038/s41467-024-50128-z